Hola !  Yo  tambien tengo un Honda Civic Sir 1999  y tengo un problema parecido  mi  ventilador  entra bien y en el tacometro de la temperatura solo llega a la mitad  tal pareciera que no se calienta  pero despues de correrlo un rato  me bota el agua por el deposito  y se oye  como esta hirviendo el agua,  no sé  a que se deba  esto me pueden acesorar ?

Saludos

ESTIMADO AMIGO : cuando devuelve el refrigerante al deposito de reserva o evapora el refrigerante puedenser varios las posibles causas que pueden estar afectando el funcionamiento del sistema de emfriamiento.
Posibles causa :

-tapon de radiador malo o mala aplicacion de apertura pocas libras de precion .
-radiador semi obstruido los tubos de emfriamiento.
-thermostato con abertura de funcionamiento retardada.
-thermoswich cerrando circuito a altas temperaturas.

Revisa cada componente antes mencionado y informanos como te fue con tu vehiculo.suerte O0 O0 O0 :)